（1）海水水質

水深、透明度、水溫、鹽度、pH值、懸浮物、溶解氧、無機氮（硝酸鹽、亞硝酸鹽、銨氮）、活性磷酸鹽、COD_Mn、銅、鉛、鋅、鎘、鉻、總汞、砷、石油類等。

（2）海洋沉積物

石油類、有機碳、硫化物、銅、鉛、鋅、鎘、鉻、總汞、砷、大腸菌群、糞大腸菌群、病原體等。

（3）海洋生態

葉綠素 a、初級生產力、浮游植物、浮游動物、潮下帶大型底棲生物、潮間帶大型底棲生物等。

①葉綠素a：分析水體內葉綠素a的質量濃度；

②初級生產力：測量水體透明度，根據該處水體內葉綠素a的質量濃度計算初級生產力；

③浮游植物：分析其種類組成、數量分布和密度、主要優勢種；

④浮游動物：分析其種類組成、數量分布和密度、主要優勢種；

⑤底棲生物：分析其種類組成、數量分布、主要優勢種的生物量和棲息密；

⑥潮間帶生物：分析其種類組成、數量分布、主要優勢種的生物量和棲息密度。

（4）漁業資源

漁業資源調查內容包括魚卵、仔稚魚、游泳動物等。

分析其種類組成、數量分布、主要優勢種的生物量和棲息密度。

（5）海洋生物體質量

石油烴、銅、鉛、鋅、鎘、鉻、總汞、砷等