檢測認(rèn)證人脈交流通訊錄
- 微生物多樣性測序
是基于二代高通量測序技術(shù)對樣品中的優(yōu)勢物種、稀有物種以及一些未知的物種進行檢測,獲得樣品中的微生物群落組成以及它們之間的相對豐度。具有低成本、高通量、流程自動化等優(yōu)勢。
一、樣本類型
涵蓋土壤、污泥、發(fā)酵、油污、空氣、口腔、糞便、海泥、母乳、動植物內(nèi)生菌、積雪、巖石、根基共生等,幾乎存在微生物的各種樣品均可進行試驗。
二、擴增子測序
1、16S rRNA測序(細菌多樣性研究)
2、18S rRNA測序(真核微生物多樣性研究)
3、ITS測序(真菌多樣性研究)
16S rRNA 位于原核細胞核糖體小亞基上,包括 10個保守區(qū)和9個可變區(qū),保守區(qū)在細菌間差異不大,可變區(qū)具有屬或種的特異性,隨親緣關(guān)系不同而存在差異。16S rDNA適用于細菌系統(tǒng)發(fā)育和分類鑒定的指標(biāo)。
16S rDNA擴增子測序,通常是選擇1-2個可變區(qū),利用保守區(qū)設(shè)計通用引物進行 PCR 擴增,再對可變區(qū)進行測序分析和菌種鑒定。
16S rDNA擴增子測序技術(shù)是研究環(huán)境樣品中微生物群落結(jié)構(gòu)組成、挖掘樣品之間差異的重要手段。同理18S rRNA 和ITS測序分別是針對真核微生物和真菌多樣性研究的分類鑒定手段。
實驗流程:樣品準(zhǔn)備、DNA提取、DNA檢測、PCR擴增、產(chǎn)物純化、文庫制備、文庫質(zhì)檢、上機測序、生信分析。
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