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頻譜分析儀有兩種主要結構：掃描類型和FFT。由于FFT結構中測量頻率的限制，一般只用于低頻，而掃頻類型***用于射頻和微波領域。

頻率掃描到FFT的優點是：寬頻率范圍，低DANL，大動態范圍等。

FFT相對于頻率掃描的優點是：實時測量

當然，一些掃頻譜儀還具有FFT功能，如PSA，通用頻譜分析儀，后端接收信號的AD采集，然后由DSP處理，可以實現VSA（矢量信號分析儀）的功能，例如ESA + 89601A。

當然，目前的頻譜分析儀功能也可以擴展，如NF測試，相位噪聲測試，數字調制測試等，但這些通常用作選項，這意味著需要額外的資金。

頻譜分析儀，其主要作用是針對各式各樣的調制信號、調幅、調頻等的頻譜進行一個觀察，從而實現調制度及調制質量的勘察。不僅如此，頻譜分析儀還能測量各種信號源當中的單邊帶相位噪聲，檢查信號當中的諧波失真情況，監視某段頻率范圍內的無線信號分別情況等等。